在关注日本垃圾分类回收与焚烧的同时，应该注意到，垃圾灰的填埋工作也同样重要，因为它是整个处理工作的最后一环，也是最占地方的一环。自从1900年《污物处理法》颁布后，日本各地方自治体有义务独立处理垃圾。从某种意义上讲，在寸土寸金的东京，合理填埋垃圾灰是整个处理过程中最重要的一环。
伴随着法律的颁布，江户（东京）政府从明治时代就开始填埋垃圾。最初只是将未处理的垃圾堆在一起埋掉了事，但由于垃圾总量少以及分类回收工作的彻底，填埋速度远没有达到土壤的分解速度。明治时代的垃圾填埋并不是什么社会问题。
然而到了昭和中后期，高度成长的经济也让日本深受垃圾问题的困扰，因焚烧能力不足，东京的部分垃圾被直接填埋在东京湾，导致填埋场周边环境严重恶化。1971年，时任东京都知事的美浓部甚至提出“垃圾战争”口号，历时多年才初步缓解了这场危机，但也同时催生了东京湾内大片填海造出的新地。
到了今天，东京的垃圾填埋已经实现了技术化与合理化，每堆3米垃圾灰就在上面覆盖50厘米沙土，最终筑成一个个等腰梯形的垄，上下镶嵌在一起，像盖房子一样分段向上码放，称之为“三明治工法”。这样一来，垃圾灰就不会被风吹走，也可以防止发生虫害。
尽管如此，昭和年代的垃圾后遗症依然存在，甚至成了制约东京经济发展的关键要素。那就是垃圾填海已经面临极限。为保障航运，政府于1998年划定了东京最后一块垃圾“圣地”（图中空白划彩线处）。如果这块海域被填满，东京就再无海可填。
为此，如何高效地利用这块海域，成了政府要考虑的首要问题。此前专家团队建议从减少垃圾灰入手，用高温将灰融化分解成沙子，再将其用于土木工程建设。然而丰岛区垃圾焚烧场厂长浅川胜男分析，这种方法要消耗极大量的热能，产出的沙子再利用率也不高，现在看来是一种得不偿失的办法。
于是，东京的垃圾处理部门在寻找新解决办法的同时，也开始着手推动向海外出口垃圾处理技术。据东京二十三区清扫一部事务组合的岛田纪行介绍，目前该部门已经在中国及东南亚国家展开了推广与调查。虽然出口的主体是垃圾焚烧炉的技术，但伴随而来的比如垃圾灰等各种副产品输出，也能为东京解决实际问题。
当然，即使这些手段都失败了，东京的垃圾处理还有最后一招，那就是将垃圾灰运到管辖区内的海上岛屿，在那里继续填海。但是，这不仅会使处理成本大幅上升，也必定会招来当地居民的反对。因此，将垃圾灰卖到海外去，恐怕是东京政府打得最如意的算盘了。
